L'OMEDIT est positionné en appui aux établissements et à l'ARS dans les démarches de contractualisation visant le bon usage et l'utilisation efficiente des produits de santé.
L'OMEDIT est neutre et indépendant vis-à-vis du pilotage du Contrat d'Amélioration de la Qualité et de l'Efficience des Soins.
L'OMEDIT participe à l'analyse des contrats mais la négociation, les décisions et le suivi des contrats sont des prérogatives exclusives de l'ARS.